VODIČ ZA POČETNIKE

Kako koristiti G25 Directory

Dodaj svoj profil, istraži obiteljsko podrijetlo i izvezi koordinate s odabranog područja.

Ukratko

Dodaj svoj profil

Odaberi Dodaj svoje podatke i prijavi se Google računom. Zalijepi svojih 25 G25 koordinata, odaberi scaled ili raw i označi jesu li simulirane. Dodaj približno mjesto obiteljskog podrijetla, neobaveznu napomenu i haplogrupe te pošalji na pregled.

Istraži i izvezi

Pregledavaj bez računa. Filtriraj po državi, regiji, haplogrupi ili izvoru. Odaberi Označi područje i označi dva suprotna kuta na karti pa izvezi odgovarajuće koordinate. Koristi isti format kao u referentnom skupu.

Možeš navesti državu i regiju obiteljskog podrijetla svake bake i djeda. Filtriraj profile sa svo četvero iz iste regije, iz više regija ili s nepotpunim podacima. Oznake se temelje na korisničkim unosima i nazivima mjesta; ne potvrđuju podrijetlo. Prvi put koristiš G25? U nastavku su objašnjene koordinate, DNK testovi i haplogrupe.

01 / PROJEKT

Što je G25 Directory?

Karta zajednice na kojoj punoljetne osobe mogu dobrovoljno objaviti pseudonim, scaled ili raw G25 koordinate, približno mjesto obiteljskog podrijetla i neobavezne Y-DNA i mtDNA haplogrupe. Odobrene profile moguće je istraživati i izvesti za kompatibilne alate.

Točka nije dokaz. Točka predstavlja približnu lokaciju koju je odabrala osoba, a ne mjesto rođenja izvedeno iz DNK, potvrdu etničke pripadnosti ili medicinski nalaz.
02 / POSTUPAK

Četiri koraka do objave

1

Napravi DNK test

Napravi autosomalni DNK test, primjerice AncestryDNA, MyHeritage DNA ili 23andMe. Uzorak se uzima slinom ili brisom obraza, ovisno o testu.

2

Preuzmi sirove genotipske podatke

Kad rezultati budu gotovi, preuzmi datoteku sa sirovim genotipskim podacima od tvrtke koja te testirala. Čuvaj je privatno.

3

Pribavi G25 koordinate

Naruči koordinate od odgovarajuće usluge ili po želji izradi jasno označenu simulaciju iz K36 rezultata.

4

Pošalji na pregled

Prijavi se Google računom, unesi koordinate i približnu lokaciju, pročitaj informacije o privatnosti i pošalji na moderaciju. U javni direktorij ulaze samo odobreni profili.

Kako izgleda kućni test? Naruči kit kod pružatelja usluge dostupnog u tvojoj zemlji; kad stigne, registriraj barkod ili aktivacijski kod, slijedi upute za slinu ili bris obraza, pošalji uzorak laboratoriju i pričekaj rezultate na svojem računu. Sadržaj kompleta i povratna poštarina ovise o pružatelju usluge i zemlji.
AncestryDNA

Registriraj kit, daj uzorak sline i vrati ga prema uputama za slanje iz svoje zemlje. Upute za test ↗

MyHeritage DNA

Aktiviraj kit prije slanja, a zatim uzmi uzorak priloženim brisom obraza. Aktivacija ↗

23andMe

Registriraj epruvetu prije slanja, slijedi upute za prikupljanje sline i pošalji paket. Kako započeti ↗

03 / VRSTE TESTOVA

DNK array test nasuprot WGS-u

SNP array / chip

Odabrani markeri

Genotipski čip provjerava odabrane položaje (SNP-ove) u genomu, često stotine tisuća. Ne čita čitav genom. Često je dovoljan za analizu podrijetla i kompatibilan G25 zahtjev.

WGS

Sekvenciranje cijelog genoma

WGS očitava DNK kroz većinu genoma i može dati znatno bogatije podatke o varijantama. I dalje su važni pokrivenost, kvaliteta i format datoteke. Obična izvezena SNP datoteka iz WGS usluge nije isto što i potpuni sekvencijski podaci.

MyHeritage je prešao na WGS za nove laboratorijske uzorke; stariji kitovi mogu biti array testovi, a običan raw izvoz može i dalje biti SNP datoteka. Provjeri tehnologiju i dostupne izvoze svojeg kita. MyHeritage objašnjenje ↗

04 / TVOJA DATOTEKA

Gdje preuzeti DNK podatke?

AncestryDNA

Otvori DNA Settings → Download or Delete → Download DNA data; potvrdi račun i preuzmi datoteku preko poveznice iz e-pošte.

Službene upute ↗

MyHeritage DNA

Otvori DNA → Manage DNA kits → izbornik s tri točkice → Download; slijedi upute iz e-pošte. Preuzimanje pokreće upravitelj kita.

Službene upute ↗

23andMe

Otvori postavke računa ili Resources → Browse Raw Genotyping Data → Download. Zahtjev može zahtijevati potvrdu identiteta i vrijeme obrade.

Službene upute ↗
Čuvaj sirovu datoteku privatno. Prije slanja genetskih podataka nekoj usluzi pročitaj njezine uvjete privatnosti.
05 / GLOBAL25

Što su G25 koordinate?

Global25 (G25) prikazuje genetski uzorak pomoću 25 koordinata u prostoru glavnih komponenti izvedenih iz referentnih uzoraka. Koordinate sažimaju obrasce genetske varijacije za istraživačke usporedbe populacija; nisu postoci podrijetla, mjera nacionalnosti ni medicinski nalaz.

Scaled

Scaled koordinate

Koordinate pomnožene faktorima skaliranja za pojedine osi. Koristi ih samo sa scaled referentnim skupovima.

Raw

Raw koordinate

Neskalirane koordinate u istom koordinatnom sustavu. Koristi ih samo s raw referentnim skupovima.

Nemoj miješati scaled i raw koordinate u istoj usporedbi. Redak obično sadrži oznaku uzorka i 25 brojeva odvojenih zarezima.

06 / KAKO DOBITI KOORDINATE

Izravni G25 ili simulacija iz K36

IZRAVNI ZAHTJEV

G25 Requests

Zasebna usluga G25 Requests trenutačno navodi obradu komprimiranih DNK datoteka (.zip ili .gz) radi izračuna G25 koordinata. Prije plaćanja ili učitavanja provjeri aktualnu cijenu, podržane formate i pravila privatnosti na toj stranici. G25 Directory nije ta usluga i ne prima ondje učitanu DNK datoteku.

g25requests.app ↗
PROCJENA

Simulirani G25 iz Eurogenes K36

Ako imaš postotke Eurogenes K36, simulator K36 → G25 može procijeniti profil s 25 koordinata statističkom pretvorbom. Jedan od načina jest dobiti K36 rezultat preko GEDmatcha pa ga unijeti u simulator. Dostupnost i uvjeti pristupa ovise o tim vanjskim uslugama.

GEDmatch ↗ · Alat K36 → simulirani G25 ↗

Nije isto. G25 iz K36 je aproksimacija, a ne izravno izračunati G25. Pri objavi ovdje odaberi „Simulirane” kao izvor. Procjenu nemoj označiti kao izravno izračunate koordinate.
07 / HAPLOGRUPE

Y-DNA i mtDNA: dvije linije obiteljskog stabla

Haplogrupa je grana genetskog obiteljskog stabla određena zajedničkim naslijeđenim varijantama. Prati jednu liniju predaka, a ne cjelokupno podrijetlo.

Y-DNA

Izravna očinska linija

Y kromosom obično se prenosi s oca na sina. Njegova haplogrupa prati oca, njegova oca i tako dalje. Za osobni Y-DNA rezultat potreban je Y kromosom.

mtDNA

Izravna majčinska linija

Mitohondrijsku DNK od majke nasljeđuju djeca oba spola. Prati majku, njezinu majku i tako dalje; dalje se u pravilu prenosi preko majki. Nije isto što i X kromosom.

Nijedna haplogrupa ne opisuje cijelo podrijetlo očeve ili majčine strane. Osobe iste haplogrupe mogu imati različito autosomalno podrijetlo.

Što upisati? Oba su polja neobavezna. Prepiši oznaku iz rezultata svojeg testa, primjerice I-PH908 ili H1. Ako je nepoznata ili nije testirana, ostavi prazno. Nemoj zaključivati haplogrupu iz G25 koordinata, prezimena ili nacionalnosti.

Pročitaj više: MedlinePlus Genetics ↗ · NHGRI: mtDNA ↗

08 / KARTA I IZVOZ

Pronađi i izvezi željene profile

Filtriraj direktorij

Pretraži profil ili mjesto, odaberi državu ili regiju te scaled ili raw koordinate. Filtrom izvora uključi ili isključi simulacije.

Označi područje

Odaberi alat za označavanje područja na karti i klikni dva suprotna kuta pravokutnika. Područje se kombinira s trenutačnim filtrima. Ukloni odabir za ponovno pretraživanje cijele karte.

Provjeri prije preuzimanja

Otvori dijalog za izvoz i provjeri broj profila te pregled koordinata. Preuzmi tekstualnu datoteku za kompatibilan alat za analizu. Scaled i raw skupove drži odvojeno.

Provjeri status objave

Nova objava čeka moderaciju. Nakon odobrenja vidljiva je drugima. Vlastitu objavu možeš obrisati iz njezinih detalja. Demo profili su izmišljeni i nisu za genetsku analizu.

09 / PRIVATNOST

Prije nego što objaviš

Možeš koristiti pseudonim, ali genetske koordinate zajedno s obiteljskim podrijetlom ili haplogrupama i dalje mogu omogućiti identifikaciju. Objavljuj samo vlastite podatke, koristi približno mjesto obiteljskog podrijetla umjesto kućne adrese i imaj na umu da se odobrene koordinate mogu preuzeti. Brisanje profila ne može povući već izvezene kopije.

Istraži G25 Directory